该保护区管理处办公楼建设在海边，该管理处还设置了市海洋与渔业环境监测站，并将建设大亚湾水产资源种质中心及科普教育基地。

　　据了解，大亚湾水产资源省级自然保护区涉及惠州、深圳两市海域，是我省乃至全国一个不可多得的生物多样性区域，被称为南海水产资源的种质资源库，保护着987平方公里1300多种海洋生物，既是我国惟一的鲷科鱼类自然产苗区，又是我省惟一的马氏珠母贝自然产苗区。